Koekelare was ooit 13 windmolens rijk.  De Hovaeremolen is de laatste die min of meer overeind blijft.  De molen moet oorspronkelijk uit de 17 de eeuw dateren en was een klassieke houten staakmolen.  De molen wisselde heel vaak van pachter en eigenaar tot in 1875 Louis Denecker als nieuwe molenaar arriveerde.  Deze familie is tot op het einde de molen trouw gebleven. Stilaan verloederde de molen maar in 1968 kocht de gemeente de molen aan en werd in 1973 als monument geklasseerd. In 1987 kocht de VZW Hovaeremolen -, een groep van 7 Koekelarenaars -  de molen van de gemeente aan.  Zij planden enkele dringende herstellingswerken in afwachting van de definitieve restauratie.  Het is de bedoeling dat de molen weer volledig in werking gesteld wordt. Voor de restauratie deed men beroep op de provincie,de  staat en privé voor subsidiëring. Men voorziet in de toekomst van molenfeesten die zouden helpen om de kosten te dekken voor het herstel van de molen.